📱 حمّل التطبيق
من لبنان لكل لبنان
اخبار الموقع
انتخابات الكنيست الإسرائيلي 2026: نتنياهو يتقدم ويفقد الأغلبية…الموت يفجع الممثل رودريغ سليمان برحيل والده إبراهيم سليمان… وكلمات مؤثرة تختصر وجع الفراقعاجل: انتخابات الكيان الإسرائيلي 2026.. الليكود يتصدر ولا أغلبية لنتنياهو أو المعارضة في النتائج الأوليةدراسة علمية تكشف مفاجأة بشأن أوميغا 3.. هل تحمي مكملات زيت السمك الذاكرة من ألزهايمر؟زلزال في عالم الذكاء الاصطناعي.. «أنثروبيك» تكشف مليارات الأرباح والخسائر وتفتح معركة السيطرة على مستقبل التكنولوجياانتخابات العدو الإسرائيلي.. إقبال عربي لافت ونتنياهو أمام اختبار مصيريالكرة الذهبية 2026.. هاري كين أفضل لاعب في العالم وإسبانيا تسيطر على الجوائزأثناء أعمال تنظيف.. عثروا على جثة متحللة!
العلوم و التكنولوجيا

Random heteropolymers as enzyme mimics

Random heteropolymers as enzyme mimics

  • Breslow, R. Artificial enzymes. Science 218, 532–537 (1982).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • DeGrado, W. F., Wasserman, Z. R. & Lear, J. D. Protein design, a minimalist approach. Science 243, 622–628 (1989).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Kuhlman, B. et al. Design of a novel globular protein fold with atomic-level accuracy. Science 302, 1364–1368 (2003).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Castriciano, M. A., Romeo, A., Baratto, M. C., Pogni, R. & Scolaro, L. M. Supramolecular mimetic peroxidase based on hemin and PAMAM dendrimers. Chem. Commun. 14, 688–690 (2008).

    Article 

    Google Scholar 

  • Schmidt, B. V. K. J., Fechler, N., Falkenhagen, J. & Lutz, J.-F. Controlled folding of synthetic polymer chains through the formation of positionable covalent bridges. Nat. Chem. 3, 234–238 (2011).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Terashima, T. et al. Single-chain folding of polymers for catalytic systems in water. J. Am. Chem. Soc. 133, 4742–4745 (2011).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Wiester, M. J., Ulmann, P. A. & Mirkin, C. A. Enzyme mimics based upon supramolecular coordination chemistry. Angew. Chem. Int. Ed. 50, 114–137 (2011).

    Article 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Kaphan, D. M., Levin, M. D., Bergman, R. G., Raymond, K. N. & Toste, F. D. A supramolecular microenvironment strategy for transition metal catalysis. Science 350, 1235–1238 (2015).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Nath, I., Chakraborty, J. & Verpoort, F. Metal organic frameworks mimicking natural enzymes: a structural and functional analogy. Chem. Soc. Rev. 45, 4127–4170 (2016).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Liu, Q., Wang, H., Shi, X. H., Wang, Z.-G. & Ding, B. Q. Self-assembled DNA/peptide-based nanoparticle exhibiting synergistic enzymatic activity. ACS Nano 11, 7251–7258 (2017).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Mundsinger, K., Izuagbe, A., Tuten, B. T., Roesky, P. W. & Barner-Kowollik, C. Single chain nanoparticles in catalysis. Angew. Chem. Int. Ed. 63, e202311734 (2024).

    Article 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Lutz, J.-F., Ouchi, M., Liu, D. R. & Sawamoto, M. Sequence-controlled polymers. Science 341, 1238149 (2013).

    Article 
    PubMed 

    Google Scholar 

  • Lombardi, A., Pirro, F., Maglio, O., Chino, M. & DeGrado, W. F. De novo design of four-helix bundle metalloproteins: one scaffold, diverse reactivities. Acc. Chem. Res. 52, 1148–1159 (2019).

    Article 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Rose, G. D., Fleming, P. J., Banavar, J. R. & Maritan, A. A backbone-based theory of protein folding. Proc. Natl Acad. Sci. USA 103, 16623–16633 (2006).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Zaccai, G. How soft is a protein? A protein dynamics force constant measured by neutron scattering. Science 288, 1604–1607 (2000).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Henzler-Wildman, K. & Kern, D. Dynamic personalities of proteins. Nature 450, 964–972 (2007).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Magazù, S. et al. Protein dynamics as seen by (quasi) elastic neutron scattering. Biochim. Biophys. Acta Gen. Subj. 1861, 3504–3512 (2017).

    Article 
    PubMed 

    Google Scholar 

  • Robertson, D. E. et al. Design and synthesis of multi-haem proteins. Nature 368, 425–432 (1994).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Sugase, K., Dyson, H. J. & Wright, P. E. Mechanism of coupled folding and binding of an intrinsically disordered protein. Nature 447, 1021–1025 (2007).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Hilburg, S. L., Ruan, Z., Xu, T. & Alexander-Katz, A. Behavior of protein-inspired synthetic random heteropolymers. Macromolecules 53, 9187–9199 (2020).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Jiang, T. et al. Single-chain heteropolymers transport protons selectively and rapidly. Nature 577, 216–220 (2020).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Daghrir, R. & Drogui, P. Tetracycline antibiotics in the environment: a review. Environ. Chem. Lett. 11, 209–227 (2013).

    Article 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Dill, K. A. et al. Principles of protein folding — a perspective from simple exact models. Protein Sci. 4, 561–602 (1995).

    Article 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Ruan, Z. et al. Population-based heteropolymer design to mimic protein mixtures. Nature 615, 251–258 (2023).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Artar, M., Souren, E. R. J., Terashima, T., Meijer, E. W. & Palmans, A. R. A. Single chain polymeric nanoparticles as selective hydrophobic reaction spaces in water. ACS Macro Lett. 4, 1099–1103 (2015).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Hoshino, Y. et al. The rational design of a synthetic polymer nanoparticle that neutralizes a toxic peptide in vivo. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 33–38 (2012).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Popot, J.-L. et al. Amphipols from A to Z. Annu. Rev. Biophys. 40, 379–408 (2011).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Chakraborty, A. K. & Shakhnovich, E. I. Phase behavior of random copolymers in quenched random media. J. Chem. Phys. 103, 10751–10763 (1995).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Geissler, P. L. & Shakhnovich, E. I. Mechanical response of random heteropolymers. Macromolecules 35, 4429–4436 (2002).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Panganiban, B. et al. Random heteropolymers preserve protein function in foreign environments. Science 359, 1239–1243 (2018).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Koshland, D. E. Jr The key–lock theory and the induced fit theory. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 33, 2375–2378 (1995).

    Article 

    Google Scholar 

  • Jayapurna, I. et al. Sequence design of random heteropolymers as protein mimics. Biomacromolecules 24, 652–660 (2023).

    Article 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Hoshino, T. & Sato, T. Squalene–hopene cyclase: catalytic mechanism and substrate recognition. Chem. Commun. 4, 291–301 (2002).

    Article 

    Google Scholar 

  • Moffet, D. A. et al. Peroxidase activity in heme proteins derived from a designed combinatorial library. J. Am. Chem. Soc. 122, 7612–7613 (2000).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Walker, F. A. Models of the bis-histidine-ligated electron-transferring cytochromes. Comparative geometric and electronic structure of low-spin ferro- and ferrihemes. Chem. Rev. 104, 589–616 (2004).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Tronnet, A. et al. Star-like polypeptides as simplified analogues of horseradish peroxidase (HRP) metalloenzymes. Macromol. Biosci. 24, 2400155–2400155 (2024).

    Article 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Yu, H. et al. Mapping composition evolution through synthesis, purification, and depolymerization of random heteropolymers. J. Am. Chem. Soc. 146, 6178–6188 (2024).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Arbe, A., Colmenero, J., Monkenbusch, M. & Richter, D. Dynamics of glass-forming polymers: “homogeneous” versus “heterogeneous” scenario. Phys. Rev. Lett. 81, 590–593 (1998).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Hart-Cooper, W. M., Clary, K. N., Toste, F. D., Bergman, R. G. & Raymond, K. N. Selective monoterpene-like cyclization reactions achieved by water exclusion from reactive intermediates in a supramolecular catalyst. J. Am. Chem. Soc. 134, 17873–17876 (2012).

    Article 
    ADS 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Hammer, S. C., Marjanovic, A., Dominicus, J. M., Nestl, B. M. & Hauer, B. Squalene hopene cyclases are protonases for stereoselective Brønsted acid catalysis. Nat. Chem. Biol. 11, 121–126 (2015).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Gibney, B. R. & Dutton, P. L. Histidine placement in de novo–designed heme proteins. Protein Sci. 8, 1888–1898 (1999).

    Article 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Walker, F. A., Reis, D. & Balke, V. L. Models of the cytochromes b. 5. EPR studies of low-spin iron(III) tetraphenylporphyrins. J. Am. Chem. Soc. 106, 6888–6898 (1984).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Murphy, E. A. et al. High-throughput generation of block copolymer libraries via click chemistry and automated chromatography. Macromolecules 58, 8369–8376 (2025).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Cochran, A. G. & Schultz, P. G. Peroxidase-activity of an antibody heme complex. J. Am. Chem. Soc. 112, 9414–9415 (1990).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Tracy, T. S. Atypical cytochrome P450 kinetics. Drugs R D 7, 349–363 (2006).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Wu, G.-R. et al. Efficient degradation of tetracycline antibiotics by engineered myoglobin with high peroxidase activity. Molecules 27, 8660 (2022).

    Article 
    PubMed 
    PubMed Central 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Jaacks, V. A novel method of determination of reactivity ratios in binary and ternary copolymerizations. Makromolek. Chem. 161, 161–172 (1972).

    Article 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Flynn, P. F., Mattiello, D. L., Hill, H. D. W. & Wand, A. J. Optimal use of cryogenic probe technology in NMR studies of proteins. J. Am. Chem. Soc. 122, 4823–4824 (2000).

    Article 
    ADS 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Andreini, C., Cavallaro, G., Lorenzini, S. & Rosato, A. MetalPDB: a database of metal sites in biological macromolecular structures. Nucleic Acids Res. 41, D312–D319 (2013).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Ravel, B. & Newville, M. ATHENA, ARTEMIS, HEPHAESTUS: data analysis for X-ray absorption spectroscopy using IFEFFIT. J. Synchrotron Radiat. 12, 537–541 (2005).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 

  • Martínez, L., Andrade, R., Birgin, E. G. & Martínez, J. M. PACKMOL: a package for building initial configurations for molecular dynamics simulations. J. Comput. Chem. 30, 2157–2164 (2009).

    Article 
    ADS 
    PubMed 

    Google Scholar 

  • Shu, J. Y. et al. Amphiphilic peptide−polymer conjugates based on the coiled-coil helix bundle. Biomacromolecules 11, 1443–1452 (2010).

    Article 
    PubMed 
    CAS 

    Google Scholar 


  • ■ مصدر الخبر الأصلي

    نشر لأول مرة على: www.nature.com

    تاريخ النشر: 2025-12-31 02:00:00

    الكاتب: Hao Yu

    تنويه من موقع “yalebnan.org”:

    تم جلب هذا المحتوى بشكل آلي من المصدر:
    www.nature.com
    بتاريخ: 2025-12-31 02:00:00.
    الآراء والمعلومات الواردة في هذا المقال لا تعبر بالضرورة عن رأي موقع “yalebnan.org”، والمسؤولية الكاملة تقع على عاتق المصدر الأصلي.

    ملاحظة: قد يتم استخدام الترجمة الآلية في بعض الأحيان لتوفير هذا المحتوى.