أصدر العلماء اليوم “معاينة سريعة” لنموذج جديد مفتوح المصدر للذكاء الاصطناعي (AI). يتنبأ بهياكل ثلاثية الأبعاد للبروتينات، ونقول أنه قريب من مطابقة أداء جوجل DeepMind الثورية للطي البروتين AI AlphaFold3.

تم تطوير النظام، المسمى OpenFold3، بواسطة اتحاد OpenFold¹، وهو تعاون غير ربحي بين مجموعات بحثية أكاديمية وخاصة، ومقره في ديفيس، كاليفورنيا. يستخدم OpenFold3 تسلسل الأحماض الأمينية للبروتينات لرسم خريطة لبنيتها ثلاثية الأبعاد ونمذجة كيفية تفاعلها مع الجزيئات الأخرى، مثل الأدوية أو الحمض النووي.

لا تزال الأداة لا تتمتع بنفس وظيفة AlphaFold3، لكننا “أردنا تقديم شيء ما للمجتمع في أقرب وقت ممكن”، كما يقول وودي شيرمان، رئيس اللجنة التنفيذية للاتحاد، وكبير مسؤولي الابتكار في شركة Psivant Therapeutics في بوسطن، ماساتشوستس. ويأمل الفريق في استخدام تعليقات الباحثين بعد إصدار المعاينة لتحسين النموذج.

الإصدار الكامل قادم

تم تدريب النظام على أكثر من 300000 بنية جزيئية وقاعدة بيانات تركيبية تضم أكثر من 40 مليون بنية. وقد كلف تطويره 17 مليون دولار أمريكي حتى الآن.

على عكس AlphaFold3، المتاح للاستخدام الأكاديمي المقيد، يمكن لأي باحث أو شركة أدوية استخدام OpenFold3. يقول شيرمان: “إنها خطوة كبيرة إلى الأمام من حيث إضفاء الطابع الديمقراطي على أدوات البيولوجيا الهيكلية للذكاء الاصطناعي”.

يشارك إصدار المعاينة كود OpenFold3 مع الباحثين ويسمح لهم بالبدء في استخدامه واختباره. يقول شيرمان إن فريق الكونسورتيوم لا يزال يعمل على إدخال تحسينات فنية على النظام ويخطط لإصدار كامل في الأشهر المقبلة. ويقول: “نحن قريبون – ونعتقد، مع هذا الجهد الصغير الأخير، أننا سنصل إلى التكافؤ الكامل”. “هذه طريقة للأشخاص للتعرف على OpenFold3 والبدء في دمجه في سير العمل الخاص بهم والبدء في إنشاء الأدوات والبدء في تقديم التعليقات.”

تقول ستيفاني وانكوفيتش، عالمة الأحياء الهيكلية الحاسوبية بجامعة فاندربيلت في ناشفيل بولاية تينيسي: “أنا متحمسة لاختبار (OpenFold3) ومعرفة مدى مقارنته بالنماذج الحالية”.

نماذج مفتوحة المصدر

يعد OpenFold3 جزءًا من حملة أوسع لـ تطوير إصدارات مفتوحة المصدر من ألفا فولد 3. بدأت هذه الجهود في مايو 2024، عندما أطلقت Google DeepMind ومقرها لندن AlphaFold3 دون مشاركة الكود الأساسي الخاص بها في البداية. وانتقد الباحثون قرار الشركة الخاصة – وفي وقت لاحق، في نوفمبر 2024، أتاحت DeepMind كود AlphaFold3 وأوزان النموذج، أو جميع المعلمات القابلة للتدريب في نموذج الذكاء الاصطناعي، متاحة للأكاديميين (تظل غير متاحة للاستخدام التجاري).